• Giải thưởng Sonning (1982, trao tại Đan Mạch)
• Giải Wolf
• Kennedy Center Honours (1984)
• Giải Grammy cho (các) nghệ sĩ độc tấu nhạc cụ xuất sắc nhất (với dàn nhạc) (1962, 1963, 1965, 1982)
• Giải Grammy cho Màn trình diễn nhạc thính phòng hay nhất (1971, 1992)
• Huân chương Nghệ thuật Quốc gia (1991)[20]
• Huân chương Tự do của Tổng thống (1992)[21]
• Được bầu vào Hiệp hội Triết học Hoa Kỳ (1995)[22]
• Giải thưởng âm nhạc Polar (2000, trao tại Thụy Điển)
• Commandeur de la Légion d'honneur (1990)
• Huy chương vàng của Hiệp hội giao hưởng nhạc Hoàng gia (1991)
• Khán phòng Carnegie Midtown, Manhattan, New York: khán phòng chính được mang tên ông vào năm 1997.

Năm 2012, một con phố ở Tel Aviv được đặt tên là Stern.[1]